варианты

<?php
$catArr = array(1, 2, 5);
$catId = JFactory::getApplication()->input->getInt('virtuemart_category_id',0);
if (!in_array($catId,  $catArr)):?>
<jdoc:include type="modules" name="right" style="xhtml" />
<?php endif; ?>

не выводить модуль в категории, включая и все дочерние (не проверено)

$db=JFactory::getDbo(); 
    $query=$db->getQuery(true);
    $query->select('category_child_id')->from('#__virtuemart_category_categories')->where('category_parent_id=0');
    $db->setQuery($query);
    $catArr=$db->loadResultArray();
    $catId = JFactory::getApplication()->input->getInt('virtuemart_category_id',0);
    if (in_array($catId,  $catArr)):?>
        <jdoc:include type="modules" name="right" style="xhtml" />
    <?php endif; ?>